CHKBiotech töötas edukalt välja koronaviiruse variantide avastamiskomplekti

Lõuna-Aafrika uus koroonaviiruse varieeruv tüvi 501Y-V2
18. detsembril 2020 tuvastas Lõuna-Aafrika Vabariik uue koronaviiruse 501Y-V2 mutandi. Nüüd on Lõuna-Aafrika mutant levinud enam kui 20 riiki. Katsed on näidanud, et uue koroonaviiruse mutandid võivad kanda teisi K417N / T, E484K ja N501Y mutatsioonide uusi koronaviiruse variante, mis võivad vähendada vaktsiini poolt indutseeritud plasma neutraliseerivate antikehade neutraliseerimisvõimet. Võrreldes võrdlusgenoomiga Wuh01 (järjekorranumber MN908947) on Lõuna-Aafrika mutantses genoomjärjestuses 501Y.V2 23 nukleotiidivarianti. Sellel on sama N501Y mutatsioon kui Suurbritannia mutandi B.1.1.7 alamtüübil, kuid sisaldab siiski S-valgu kahes põhisaidis E484K ja K417N mutatsioone, millel on potentsiaalselt oluline mõju viiruse nakkusvõimele.

Uus koroonaviirus on üheahelaline RNA viirus, mida genoomi mutatsioonid esinevad sagedamini. Ühe sihtmärgi tuvastamine võib hõlpsasti põhjustada viiruse vähese koormuse ja muteerunud viirusetüvedega proovide tuvastamata jätmise. Uuesti läbivaatamise määr ühe positiivse tulemuse korral sihtmärgi tuvastamisel võib ulatuda üle 10%, mis võib suurendada töökoormust ja pikendada diagnoosimise aega. Mitme sihtmärgi tuvastamine ja iga sihtmärgi tulemuste vastastikune kontrollimine võib suurendada avastamise määra ja hõlbustada varajast diagnoosimist.

news1

Joonis 1. Uue koronaviiruse nakkusmehhanismi skemaatiline diagramm

Uus Suurbritannia koroonaviiruse mutant B.1.1.7
26. detsembril 2020 avaldati veebis B.1.1.7 tüve esimene teadustöö. Londoni Suurbritannia hügieeniinstituut ja troopilised haigused kinnitasid, et B.1.1.7 tüvi on levimisvõimelisem kui muud tüved, mis oli üle 56% (95% CI 50–74%). Kuna sellel uuel mutantsel tüvel on ilmsem ülekandevõimsus, on COVID-19 juhtimine muutunud keerulisemaks. Järgmisel päeval laadis Ühendkuningriigi Birminghami ülikool MedRxivi kohta üles artikli. Uuringust selgus, et B.1.1.7 mutantse tüvega (S-geeni väljalangemine) nakatunud patsientidel oli ORF1ab ja N viiruse geenikoopiate arv märkimisväärselt suurenenud; seda nähtust jälgiti populatsioonis. Selles artiklis tuuakse välja, et Suurbritannia mutantiga B.1.1.7 nakatunud patsientidel on viiruskoormus oluliselt suurem, seega võib see mutant olla ka patogeensem.

1

Joonis 2. Suurbritannia koroonaviiruse mutantses tüves B.1.1.7 sisalduv genoomi mutatsioonijärjestus

2

Joonis 3. N501Y mutatsioon toimus nii Suurbritannias kui ka Lõuna-Aafrikas Variandid

Uute koronaviiruse variantide tuvastuskomplekt
Chuangkun Biotech Inc. on edukalt välja töötanud uute koronaviiruse variantide B.1.1.7 ja 501Y-V2 avastamiskomplekti.

Selle toote eelised: kõrge tundlikkus: 4 sihtmärgi samaaegne tuvastamine, hõlmates mutantse tüve B.1.1.7 ja Lõuna-Aafrika mutantsete tüvede 501Y.V2 peamisi mutatsioonikohti. See komplekt võimaldab samaaegselt tuvastada N501Y, HV69-70del, E484K mutatsioonikohti ja uut koronaviiruse S geeni; Kiire test: proovide kogumisest kulub tulemuse saamiseks vaid 1 tund 30 minutit.

3

Joonis 4. COVID-19 Suurbritannia variatsioonikõvera tuvastamine

4

Joonis 5. COVID-19 Lõuna-Aafrika variatsioonikõvera tuvastamine

5

Joonis 6. Uue koronaviiruse amplifitseerimiskõver metsikut tüüpi

Pole selge, kuidas need mutatsioonid koguvad pandeemia COVID-19 õiguse uut pikaajalist mõju. Kuid see tuletab meile meelde, et need mutatsioonid võivad mõjutada vaktsineerimisega kaasnenud loodusliku immuunsuse ja immuunsuse efektiivsust. Samuti tuletab see meile meelde, et peame pikka aega pidevalt jälgima uut koronaviirust ja ajakohastama vaktsiini COVID-19, et tulla toime uue koronaviiruse arenguga.


Postituse aeg: märts-12-2021